集约化畜牧业对生物安全提出了更高的要求。但目前行业对生物安全的重视程度及相应的应用技术研究与集约化发展速度很不匹配，很多所谓的生物安全措施只是一定程度上的“形式主义”。一些做法也只能是寻求一种“心理安慰”。
一、 按照制定的免疫程序进行免疫，畜禽就安全了，消毒不消毒并不重要。
实际上，免疫不是医治百病的干金良方。免疫后机体应答产生了一定水平的抗体才可预防相应疾病的发生。而免疫应答产生抗体的水平会受到免疫时间及免疫方式、疫苗质量、疾病感染压力、动物健康水平、饲料质量等诸多因素的影响。因此．按设定的程序进行免疫只是畜牧场生物安全措施的关键步骤之一。
二、消毒药定期轮换使用，才能避免抗药性的发生。
消毒药是否轮换使用取决于所使用消毒药的杀菌机理。所选用的消毒药的杀菌机理是穿透性杀菌方式，则不会产生耐药性的问题。穿透性杀菌方式下，消毒药直接穿透细菌或病毒的细胞膜，氧化细菌、病毒内的脂质、蛋白成分及DNA而杀灭细菌、病毒，一旦消毒药接触到细菌、病毒，即可完成杀灭过程。细菌、病毒没有机会对消毒药产生适应性改变(通过变异以适应)。具有穿透性杀菌功能的消毒药有：过氧化物类(如：卫可、过氧乙酸等)、卤素类(二氧化氯、漂白粉、碘制剂等)。
所选择的消毒药的杀菌机理是接触性杀菌方式，则易于产生耐药性的问题。该类消毒药在杀灭细菌、病毒时需要在其周围有一定的有效浓度，当其周围的消毒药浓度不致以杀灭细菌、病毒时，细菌、病毒就会对其产生适应性改变(变异)而产生抗药性。具有接触性杀菌功能的消毒药有：季铵盐类(癸甲溴／氯胺、苯扎溴胺等)、酒精类、醛类、酚制剂等。
消毒药轮换应遵循的原则：根据畜牧场面临的生物安全情况确定。
三、 高压水冲洗房舍就可以获得良好的清洁效果，再配合彻底的消毒即可高枕无忧。
高压水只能冲走附于舍内表面的有机物，排除至舍外，对其它车间或整个生产区带来新的污染。舍内墙面、设备表面的生物膜仍会持续对生产产生不良影响。