一、莲藕褐斑病：是莲藕常见的一种叶部病害，在叶片上产生淡褐色病斑，使病叶局部干枯。
防治方法：合理密植，确保藕田通风透光；适当增施磷、钾肥，提高植株抗病性；及时清除病株残体，防止病害传播蔓延。发病初期，及时用25%多菌灵600倍液或75%百菌清1000倍液喷雾。
二、莲藕黑斑病：又叫褐纹病，仅发生在叶片上，严重时病斑汇合，叶片枯黄。
防治方法：冬季清除田间病株残叶，并集中烧毁。发病初期及时摘除病叶，并用70%甲基托布津1000倍液、65%代森锌600倍液或1:1:160～200波尔多液喷雾防治，一般每隔10～15天喷一次，连喷2～3次。
三、莲藕腐败病：又叫枯萎病，主要为害地下茎，地上部分叶片也可发病。发病严重时，全田呈火烧状。
防治方法：（1）农业防治。合理轮作是目前防治此病最有效的方法，轮作周期一般为2～3年。注意从无病藕田选择健株作种藕，防止带菌传病。合理施肥，不偏施氮肥，增强植株抗病性。（2）药剂防治。种植前，用70%甲基托布津1000倍液或75%百菌清800倍液喷雾闷种，盖农膜密闭24小时，晾干后种植。发病初期，用75%百菌清0.5千克，加泥土30千克，拌匀后撒入浅水田内，或用50%多菌灵可湿性粉剂600～800倍液、50%托布津可湿性粉剂800～1000倍液，每隔7～10天喷一次，连喷2～3次，均有一定效果。